中石油在蘇丹擁有海外最大最完整的油氣產業鏈。南部蘇丹獨立，給深耕細作了15年的中石油出了一道難題。
南部蘇丹全民公投的結果于2月7日公布。南部390萬選民中，98.83%投票支持與信奉伊斯蘭教的北部地區分離。這意味著，在經歷了長達50年時斷時續的內戰之后，南部蘇丹將于今年7月9日宣布獨立。
盡管在意料之中，這個事實還是讓外資石油公司忐忑不安。蘇丹石油產量主要集中于南部（約占70%），而石油煉化和出口基礎設施卻基本建在北方。根據2005年蘇丹內戰雙方簽署的《全面和平協議》，石油收益由南北政府五五分賬。但南部蘇丹卻多次抱怨分得太少，認為產油量很少的北方拿走了原本屬于南部蘇丹的石油財富。此背景下，南部蘇丹獨立，直接意味著7月9日之后，外資石油公司將不得不同蘇丹南、北政府分別重簽協議。考慮到這些石油公司的上中下游資產將被一條國界分拆至兩個國家，利益糾紛幾乎不可避免。
據中石油駐蘇丹的一位管理人員透露，中石油目前在蘇丹擁有1/2/4區塊、3/7區塊、6區塊、15區塊四個上游投資項目，還參與投資建設了喀土穆煉油廠、喀土穆石油化工廠、石化貿易三個下游項目，以及1/2/4區塊、3/7區塊和6區塊的原油外輸管道。中石油的好幾個石油區塊都位于邊界線附近，目前局勢尚不明朗，充滿不確定性。
同中石油一樣，外資石油公司都希望原有合約能繼續生效。但他們也明白，擺在面前的將不是單純的商業談判，更涉及南北蘇丹政府之間的利益分配，未來談判將受到很多因素影響，包括邊界如何劃定，油氣資源和水資源如何分家，由誰來作為代表各自國家石油公司的主體，南部蘇丹是否建設自己的輸油管道，石油債務如何分擔，稅收體系如何改革等等。
另一需要擔心的因素是，南部蘇丹獨立后，中國在蘇丹的石油利益將面臨來自美國、歐洲及其他亞洲國家的挑戰。上海國際問題研究院西亞非洲中心副研究員張春在最近撰寫的一篇評論文章中指出，美國作為南部蘇丹獨立的最大支持者，很可能大舉重返。而歐洲石油公司、服務公司和二級承包商之前就沒有全面撤出蘇丹，南部蘇丹獨立后，其重返步伐甚至可能快于美國。亞洲國家中，印度、馬來西亞、新加坡等國均已在南部蘇丹油田中持股，而日本正與南部蘇丹就修建由南部蘇丹通往肯尼亞拉穆港的輸油管道展開談判。
據知情人士透露，是否參與這條南部輸油管道的修建，對中國石油公司也是難題。如果不參加，這條管道建成后，中國在北部蘇丹石油工業設施的作用將大大下降；如果參加，不僅投資回報率有待論證，還很可能招致北部蘇丹政府的不滿。
據公開資料，中國石油公司目前擁有蘇丹石油業約40%權益，蘇丹開采的約60%的石油售往中國。其中，中石油是最早來到蘇丹的中國石油公司，在蘇丹擁有其海外最大、最完整的石油產業鏈，覆蓋上中下游及其相關港口設施。
上世紀60年代，因缺乏開發石油的資金和技術，蘇丹政府邀請意大利阿吉普和英荷殼牌在北部地區勘探。美國雪佛龍也同期進入蘇丹，先是1976年在蘇丹港附近的蘇阿金（Suakin）發現天然氣田，后陸續在南部地區發現大型油田。蘇丹南方戰爭之后，雪佛龍三名雇員被反政府游擊隊殺害，公司決定放棄開采權，撤離蘇丹。1997年美國政府開始制裁蘇丹。與此同時，1996年蘇丹總統親自出面邀請中國石油公司加入。
1997年，中石油參與國際競標，獲得被雪佛龍拋棄的1/2/4區塊石油開發權。同年6月，中石油與三家伙伴共同組建聯合作業公司——大尼羅河石油作業有限責任公司，其中，中石油占股40%，馬來西亞國家石油公司占30%，印度國家石油公司占25%，蘇丹國家石油公司占5%。參股者還共同修建連接油田和北部港口的原油長輸管道。這條管道長約1506公里、管輸能力1250萬噸/年，始于蘇丹中南部的黑格里格油田，途經喀土穆，直達蘇丹港，是蘇丹原油輸送的生命線，于1999年完工。
2000年11月，中石油集團又中標蘇丹東部Melut盆地的3/7區塊石油勘探開發項目，目前有41%的權益，合作伙伴馬來西亞國家石油公司擁有40%、蘇丹國家石油公司擁有8%、中石化集團擁有6%，阿聯酋國家石油公司擁有5%。
除此之外，中石油還于1995年9月獲得位于蘇丹穆格萊德盆地西北部的6區塊的開發權，目前擁有95%的權益。2005年，中石油聯合馬來西亞國家石油公司、蘇丹國家石油公司、尼日利亞國家石油公司和HiTech公司，同蘇丹政府簽署了位于蘇丹東北部的15區勘探開發產品分成合同，中石油占股35%。
在中下游領域，中石油于1997年承諾出資50%，與蘇丹能礦部合資建設了年加工原油250萬噸的喀土穆煉油廠，并在年產量2萬噸聚乙烯的喀士穆化工廠中占有95%股份。