染色質是人體細胞內遺傳物質的載體,染色質的結構差異會在一定程度上影響不同細胞的不同功能。美國一項新研究說,可利用生成式人工智能幫助分析染色質三維結構,比傳統實驗方法更加高效便捷。
據介紹,染色質是細胞核內由脫氧核糖核酸(DNA)和蛋白質等形成的復合物,具備復雜結構,使得展開后約2米長的DNA鏈條能夠塞入直徑僅為百分之一毫米的細胞核中。染色質的結構差異會導致被有效表達的基因不同,從而影響細胞功能。
傳統上通過實驗來分析染色質結構的方法費時費力,需要約一周時間才能得到一個細胞的數據。美國麻省理工學院研究人員日前在美國《科學進展》雜志上發表論文說,利用生成式人工智能可快速、準確分析細胞中染色質結構,將這個時間縮短到若干分鐘。
研究人員開發出名為ChromoGen的人工智能模型,它由一個深度學習模型和一個生成式人工智能模型組成。前者經過訓練可“讀取”基因組,分析DNA序列和染色質中的相關信息。后者則可根據相關信息給出染色質結構,此前已用超過1100萬個染色質結構對其進行訓練。當二者集成時,可針對不同細胞環境,分析確定相關的染色質結構。
研究人員表示,這有助于更好地探索染色質三維結構如何影響單個細胞的基因表達模式和功能,從而推動生物學等領域研究。 (辛華)


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