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尋找“獨角獸”丨百奧幾何:以科學智能實現(xiàn)蛋白質“設計自由”
2025-05-28 記者 吳蔚 來源:經(jīng)濟參考報

  當人工智能“遇見”生物制造,兩大前沿技術將“碰撞”出怎樣的火花?在北京百奧幾何生物科技有限公司,記者得到了這個問題的答案:通過人工智能在科學領域的應用(AI for Science,科學智能),讓從頭“設計”蛋白質成為可能。在業(yè)界看來,這一顛覆性技術創(chuàng)新將打開萬億級的市場,由此也有望誕生千億市值的企業(yè),百奧幾何的未來可期。

  從0到1的技術創(chuàng)新

  走進百奧幾何位于北京中關村的研發(fā)中心,桌面上一個蛋白質分子三維模型分外醒目。百奧幾何創(chuàng)始人唐建向記者介紹,與大語言模型不同,由于蛋白質不僅是一個序列,而且是三維結構,而結構決定功能,因此蛋白質大模型也更加復雜。

  百奧幾何不久前正式發(fā)布了全球首個全場景原子級蛋白質大模型GeoFlow V2,該模型首次以原子級精度統(tǒng)一蛋白質結構預測與從頭設計兩大核心能力,為生命大分子提供了從理解到創(chuàng)造的一站式解決方案,可廣泛應用于包括生物醫(yī)藥、食品、化工、醫(yī)美、材料等整個生物制造領域。

  “這將為工業(yè)級蛋白質設計應用帶來更多從0到1的突破。”唐建表示,過去科學家只能去發(fā)現(xiàn)自然界中的蛋白質,或是在實驗室中通過大量試驗合成蛋白質,如今利用人工智能從海量數(shù)據(jù)學習挖掘和建模復雜規(guī)律的優(yōu)勢,就可以預測甚至設計全新蛋白質結構。

  這樣的技術突破并非僅僅停留在理論層面,而是已經(jīng)得到了實驗驗證。記者了解到,在一項復雜的功能蛋白質替代設計任務中,GeoFlow V2僅一輪生成即可獲得高性能專利級分子。相較于過去依賴5輪文庫構建與實驗迭代才能有概率篩出的分子,GeoFlow V2實現(xiàn)一步到位的定向生成,直達性能峰值,在顯著縮短研發(fā)周期的同時實現(xiàn)性能和知識產(chǎn)權的雙重突破。

  在另一項針對某高價值非天然氨基酸的研發(fā)任務中,GeoFlow V2首次挖掘并從頭設計出一款能夠催化全新反應類型的酶種,并通過兩輪AI驅動的酶定向進化將其催化活性提升65倍,構建出一條原料價格低廉、轉化率高、路徑更短的一步體外酶法合成路線,全流程僅用兩個月完成。

  “這不只是模型能力的躍升,更實現(xiàn)了‘生命分子的可編程性’向工程化與商業(yè)化可用性的大規(guī)模轉變。”唐建透露,百奧幾何已經(jīng)打通了從設計、驗證到落地的全鏈路生物制造閉環(huán),可以實現(xiàn)真正意義上的“智能創(chuàng)制”。目前,百奧幾何已與多家國內外企業(yè)達成授權合作,多個自研產(chǎn)品已達到生產(chǎn)落地水平。

  從生物醫(yī)藥到生物制造的應用拓展

  盡管百奧幾何正式運營不到三年,但是在人工智能賦能生物制造領域已經(jīng)是頭部企業(yè)。其核心團隊是生成式AI在分子生成領域的開拓者,早在2021年就將擴散模型用于分子的三維結構生成,其關鍵論文是2022年AI領域引用量排名前50的論文之一。

  作為AI制藥領域頂級科學家,唐建已獲得業(yè)界享有盛名的Mila實驗室(加拿大魁北克省人工智能研究中心)終身教職。2022年底,唐建帶領團隊回國創(chuàng)立百奧幾何,并邀請到深度學習三巨頭之一、AI之父、圖靈獎獲得者約書亞·本吉奧擔任公司首席科學顧問。

  “創(chuàng)業(yè)的過程并非一帆風順。”唐建告訴記者,剛開始公司的研發(fā)方向主要是生物醫(yī)藥抗體藥物,但是抗體藥物落地周期長、投入成本高。在不斷試錯、不斷探索中,唐建發(fā)現(xiàn)生物制造領域蛋白質有很大的機會(如生物催化酶分子的設計),于是果斷決定拓展蛋白質設計在生物制造領域的應用。

  生物制造的核心挑戰(zhàn)在于發(fā)現(xiàn)高附加值分子(如抗體、疫苗、多肽類分子)或是優(yōu)化已有的微生物菌株和生物催化酶分子,以提高生產(chǎn)效率并降低成本。因此,如何快速并準確發(fā)現(xiàn)具有高活性的蛋白質大分子就成為生物制造多個領域的關鍵。百奧幾何的技術優(yōu)勢在這一新賽道上很快如魚得水。而唐建看到的優(yōu)勢還不僅于此。

  “首先,國內超大規(guī)模市場優(yōu)勢給生物制造帶來很大機遇,從醫(yī)藥到美妝,從食品到化工,對抗體、酶等各種蛋白質的需求非常大,應用場景豐富;其次,國內的產(chǎn)業(yè)鏈、供應鏈優(yōu)勢,使生物制造從設計到實驗室再到產(chǎn)線的過程大大縮短,研發(fā)落地速度快。此外,還有成熟的制造業(yè)帶來的數(shù)據(jù)優(yōu)勢、工程師紅利帶來的人才優(yōu)勢等,加上國內的產(chǎn)業(yè)政策優(yōu)勢,讓百奧幾何集齊了天時、地利、人和。”唐建說,在當?shù)卣闹С窒拢賷W幾何已經(jīng)在北京、上海建成了高通量蛋白質實驗室,并將在深圳等地合作建廠,加速自有產(chǎn)品落地。

  從中國到世界的成長路徑

  “我們未來的一個重點是走向國際化。”唐建多次強調,未來一定是中國研發(fā)、全球生產(chǎn),這也是未來產(chǎn)業(yè)發(fā)展的一個大趨勢。

  百奧幾何還有一個長期愿景是加速中國制造實現(xiàn)數(shù)字化、智能化、綠色化、可持續(xù)發(fā)展轉型。

  作為全球新一輪科技革命和產(chǎn)業(yè)變革的重要組成部分,生物制造正從根本上變革傳統(tǒng)的生產(chǎn)方式,吸引世界各國紛紛布局。與傳統(tǒng)制造業(yè)依賴石油為基礎的化學合成帶來環(huán)境污染和高昂成本有所不同,生物制造采用微生物和生物催化技術,以玉米、秸稈等可再生生物質為原料進行產(chǎn)品合成,其效率、環(huán)保性和可持續(xù)性優(yōu)勢明顯。據(jù)預測,未來將有超過60%的產(chǎn)品采用生物制造方法生產(chǎn),其市場價值有望飆升至30萬億美元,甚至超過數(shù)字經(jīng)濟的市場規(guī)模。技術突破與政策利好頻頻出現(xiàn),生物制造賽道已處在爆發(fā)前夜。

  “萬億級的市場一定會誕生千億市值的企業(yè)。”唐建雄心勃勃。

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