因為有了云南綠大地的“前車之鑒”，再次出現的萬福生科案顯然更受關注。
與綠大地欺詐上市的“案情重大，性質極為惡劣”相比，萬福生科案明顯是“青出于藍而勝于藍”。因此，監管部門在其職責范圍內對上市公司、中介及其責任人員作出相關處罰是必然的。特別是，中國證監會對平安證券開出保薦制度推出以來最嚴厲的罰單，廣受市場各方矚目，其積極意義與深遠影響都是不言而喻的。
其實，整個萬福生科案從監管部門的處罰到平安證券設立3億元的補償基金，個中并不乏“亮點”。其一，平安證券等中介“保薦”萬福生科均“偷雞不成反蝕一把米”。保薦人、會計師事務所、律師事務所等相關中介的業務收入被沒收，并被處以2倍的罰款。這些中介機構不僅失了利，更毀了其“英名”。而且，平安證券被暫停保薦資格3個月，中磊會計師事務所更是被“掃地出門”。
其二，以往保薦工作出現問題，一般被定性為保代的“個人問題”，利益最大分食者的券商及其它人員基本上都安然無事。而此次的萬福生科案中，不僅保代被罰款與撤銷從業資格，而且保薦業務負責人、內核負責人、項目協辦人等都被追究責任，這在此前是絕無僅有的。采取“連坐”制，在擴大了處罰范圍的同時，也更有利于形成威懾力。
其三，平安證券設立3億元補償基金，開創了A股投資者利益保護的先河，值得肯定。通過設立補償基金的方式，那些深受其害的投資者利益更有了保障。立案難、訴訟難、索賠難是A股市場維權難的最主要表現，像當年的銀廣夏案，前后長達6年之久，再有信心的投資者也會被“拖垮”，從而放棄維權，這明顯不利于投資者維權與懲罰違規行為。
“史上最嚴厲的處罰”、上市公司責任人員被移送司法機關、平安證券設立補償基金等，看起來萬福生科案已經劃上了句號，但是，萬福生科案的結局并不“完美”。
首先，對上市公司的處罰太輕，監管部門應責令萬福生科立即退市。警告與30萬元的罰款，對于圈到的4.25億元巨額資金來說就是毛毛雨。如果不造假，萬福生科沒法圈到這么多資金。而今年3月14日證監會相關負責人在回應投資者維權時就曾表示，“要讓欺詐上市者直接退市、賠償投資者損失”。言猶在耳，對于萬福生科如此惡劣的欺詐上市行為，證監會卻表示其“不會觸及終止上市的條件”，令人失望。
其次，利益受損投資者可能存在補償不到位的情形。盡管有了3億元的補償基金作“后盾”，而且只要符合條件的投資者履行相關的程序就能得到補償，但對投資者來講，一方面很有可能因為時間的關系已忘記或對關鍵時點的誤解，而沒有選擇維權；另一方面由于股市持續低迷，投資者遠離股市根本沒有關注到相關的消息而錯失維權的時機；此外，也存在某些投資者因為金額太小而放棄維權的可能。但投資者的損失卻是實實在在的，而且是由于上市公司與中介機構的原因導致，沒有上市公司的造假與中介機構的未履行勤勉盡責的職責，投資者根本不會產生損失。因此，建議平安證券與中登公司等單位合作，由其主動對所有符合條件的投資者進行補償。如此，則善莫大焉。